3話に総合評価でのアイテム取得がないのは仕様ってことでいいんでしょうかね?

そうですね。
総合評価を参照するのはまだ序盤戦で戦闘の組み方に特徴付けをしづらかったために取った措置でして、
次回からは色々変わったことも出来るようになるので、多分もうやらないんじゃないかなー、と思います。
1・2・4話の方が特例ってことですね。
何よりあんまりハード限定の要素があるとノーマルよりハードの方が簡単になったりしかねんからね…… ヴァルキリープロファイルみたいに!!